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经济海藻紫菜种质资源鉴定的方法及部分DNA序列

日期:2008-06-22|人气:11|


发明人
段德麟;胡自民;赫英俊
地址
266071山东省青岛市南海路7号
概述
本发明涉及紫菜种质资源的鉴定,即经济海藻紫菜种质资源鉴定的方法及鉴定中所用的中国沿海紫菜栽培种DNA序列;步骤为:1)总DNA提取;2)以上步骤提取的DNA为模板,对总DNA进行PCR扩增反应;3)PCR产物纯化;4)纯化后的DNA进行序列测定,确立rDNAITS区,包括ITS1、5.8S和ITS2区的全序列;5)用对位排列软件进行对位排列,并辅以人工校对,用系统进化分析软件分析各样品DNA序列与数据库中各个序列间的差异。本发明提供了一种有效的提取紫菜高质量DNA的方法和利用DNA序列对紫菜种质资源进行鉴定方法,并对中国沿海紫菜的rDNAITS区序列进行了测序。
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要害点
1.经济海藻紫菜种质资源鉴定的方法,其特征在于,步骤如下:(1)总DNA提取:取新鲜健康的藻体材料,用无菌水处理后,在液氮种研磨成粉末,提取总DNA;(2)PCR扩增:利用正向引物P1:5’GGGATCCGTTTCCGTAGGTGAACCTGC3’,反向引物P2:5’GGGATCCATATGCTTAAGTTCAGCGGGT3’;以步骤(1)提取的DNA为模板,对总DNA进行PCR扩增反应;(3)PCR产物纯化;(4)DNA序列测定:纯化后的DNA进行序列测定,确立rDNAITS区,包括ITS1、5.8S和ITS2区的全序列;(5)DNA序列数据分析:待分析的rDNAITS区的序列一经测定,用对位排列软件进行对位排列,并辅以人工校对,用系统进化分析软件分析各样品DNA序列与数据库中各个序列间的差异。